Oi caro colega.
Cada computador possui um número IP e cada número IP tem suas respectivas portas.
Portanto se você abrir a porta 2000 do Servidor 1, não vai interferir no servidor 2, ou seja, você teria que abrir as portas no firewall nos IPs das maquinas.
Por Exemplo:
Servidor 1= 192.168.0.1
Servidor 2= 192.168.0.2
Abre o Firewall no Linux e habilita a porta 2000 para o IP 192.168.0.1 e para o IP 192.168.0.2
Se você não fizer isto, será dificil você resolver este problema. A menos que o servidor já tenha um outro software que utilize esta mesma porta, então ae você teria que tentar modificar a porta deste software.
Espero que isto te ajude.